De la fauna del sector, los estudios han mostrado una baja presencia de carnívoros y con hábitos más bien ocultos y muy sensibles a la presencia humana, destacando la presencia de zorro culpeo (Pseudalopex culpaeus). El mamífero grande más abundante del área es el Huemul (Hippocamelus bisulcus). Por otra parte, se han observado 23 especies de aves del área y cuatro de anfibios.
Respecto de la situación legal de predio, puede mencionarse que el predio fiscal Laguna Caiquenes ha sido entregado en administración a Aumen ONG mediante la Resolución Exenta 098-24/03/2006 de la SEREMI de Bienes Nacionales de la región de Aysén, y actualmente es un área bajo protección oficial gracias a una Autodestinación para conservación hecha por el Ministerio de Bienes Nacionales, oficializada mediante Decreto Exento 198-16/02/2009 del Ministerio de Bienes Nacionales. En la actualidad se encuentra en trámite administrativo la renovación de la concesión por parte del Ministerio de Bienes Nacionales por 30 años.